У лізосомах перетравлюються мікроорганізми і віруси, окремі компоненти клітин, цілі клітини або їхні групи. Так знищуються дефектні органели, ушкоджені чи мертві клітини.

Лізосоми руйнують старі органели самої клітини, отже, беруть участь в самооновленні клітин. При голодуванні лізосоми перетравлюють запасні речовини та зайві органели, підтримуючи існування організму.

Вакуолі - порожнини у цитоплазмі, заповнені рідиною і оточені мембраною:

• вакуолі клітин рослин - утворюються з пухирців, які відокремлюються від ендоплазматичної сітки; заповнені клітинним соком - водним розчином органічних і неорганічних сполук, серед яких є продукти обміну речовин або пігменти;  підтримують тургор, забезпечуючи пружність клітин і збереження їх форми; накопичують продукти обміну речовин або запасних поживних речовин;
• скоротливі вакуолі водоростей - формуються з елементів комплексу Гольджі; регулюють внутрішньоклітинний тиск, виводячи надлишок води з клітини; беруть участь у виведенні деяких розчинних продуктів обміну речовин.

2.2.2.2. Двомембранні органели

Пластиди - двомембранні органели, властиві тільки рослинній клітині. Вони утворюються з пропластид - ініціальних тілець меристем. 

Пропластиди - недиференційовані пластиди, що зустрічаються в меристемних клітинах коренів і пагонів, є попередниками пластид. Якщо світла немає, то в пропластиді з'являються проламелярні тільця (напівкристалічні утворення в пластидах, розвиток яких зупинився через відсутність світла) і такі пластиди називають етіопластами. На світлі вони легко перетворюються на зелені пластиди - хлоропласти. Крім хлоропластів, розрізняють хромопласти, лейкопласти, амілопласти.

Розглянемо докладніше типи пластид:

Хлоропласти - зелені пластиди, в яких відбувається фотосинтез.