Сегмент керування складається з [14]:

-                головного центра керування МСS (Master Control Station), що знаходиться в місті Colorado Springs ;

-                основної станції керування GCS (Ground Control Station), що розмішена на Гавайських островах;

-                трьох стаціонарних станцій контролю (Monitor Station). Вони знаходяться на островах: Вознесіння (Ascension) в північній частині Атлантичного океану, Дієго-Гарсія в Індійському океані та Кваджалейн в північній частині Тихого океану;

-                рухомих контрольних станцій.

Станції сегмента керування знаходяться на поверхні Землі на великих віддалях між собою. Вони безперервно приймають коливанння. випромінювані супутниками, що знаходяться в одній півкулі з станцією. Віддалі до супутників визначають через півторасекундні інтервали часу. Потім вони усереднюються для інтервалів часу рівних 15 хв. Крім цього на станціях ведеться метеорологічне зондування атмосфери по вертикалі з метою визначення поправки на тропосферу. Результати опрацювання сигналів супутників та вертикального зондування із контрольних станцій пересилають до головного центра керування. Тут обчислюють ефемериди орбіт супутників та рівняння їх хронометрів (генераторів ШСЗ) на 12 годин наперед. Ці дані пересилають на ШСЗ, а вони. в свою чергу, пересилають їх користувачам, тобто на приймачі системи. Основна станція керування має можливість маневрувати рухом супутників, тобто коректувати їх орбіту [6].

Розміщення станцій керування та контролю системи NAVSTAR/GPS  показано на рис. 2.1.