Фінансування діяльності РАТС здійснюється з коштів бюджету ШОС. Порядок фінансування РАТС визначається документами, що регламентують питання бюджету ШОС.

Основними завданнями і функціями РАТС є:

1) розробка пропозицій і рекомендацій про розвиток співпраці в боротьбі з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

2) сприяння компетентним органам Сторін у боротьбі з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

3) збір та аналіз інформації, що надходить в РАТС від Сторін, з питань боротьби з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

4) надання інформації за запитами компетентних органів Сторін;

5) сприяння у підготовці і проведенні антитерористичних командно-штабних і оперативно-тактичних навчань;

6) сприяння у підготовці та проведенні оперативно-розшукових та інших заходів по боротьбі з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

7) сприяння у здійсненні міжнародного розшуку осіб, які ймовірно зробили дані діяння, з метою їх залучення до кримінальної відповідальності;

8) участь у підготовці міжнародно-правових документів, які зачіпають питання боротьби з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

9) сприяння у підготовці спеціалістів і інструкторів для антитерористичних підрозділів;

10) участь у підготовці та проведенні науково-практичних конференцій, семінарів, сприяння в обміні досвідом з питань боротьби з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом;

11) встановлення і підтримка робочих контактів з міжнародними організаціями, що займаються питаннями боротьби з тероризмом, сепаратизмом і екстремізмом.

Виконавчий комітет складається з Директора і такого персоналу, який може знадобитися для забезпечення нормального функціонування РАТС. Структура Виконавчого комітету, а також його штатний розклад