В настоящее время проблема охраны земель встает с особой остротой, поскольку за годы кризиса были утрачены связи между агрохимической службой и хозяйствами, сокращены объемы работ по сохранению и повышению плодородия почв. Происходящие в последнее время положительные перемены в сельском хозяйстве создают условия и для возобновления планомерной и комплексной работы по охране земель сельскохозяйственного назначения.

Проводимая в последнее время Правительством РФ и органами власти Новосибирской области политика дают основания прогнозировать в перспективе существенное увеличение объемов применения средств химизации в сельскохозяйственном производстве, а в связи с этим – рост востребованности услуг агрохимической службы.

Зона обслуживания ФГУ САС «Баганская» охватывает 14 административных районов в западной части Новосибирской области, в том числе и Баганский район. Станция ведет периодическое наблюдение за показателями плодородия почв пашни в зоне обслуживания, за агроэкологическими показателями на 9 реперных участках постоянного наблюдения, осуществляет химический анализ кормов, зерна, овощей и пищевых продуктов.

После распада СССР в зоне обслуживания станции произошло резкое уменьшение объемов применения удобрений и мелиорантов. В частности, к 2003 году, по сравнению с 1991 годом, объемы применения минеральных удобрений уменьшились более чем в 90 раз, объемы внесения органических удобрений – более чем в 5 раз, прекратилось использование мелиорантов. В последние годы отмечается увеличение объемов применения минеральных и органических удобрений, однако наблюдающийся прирост все еще не соответствует потребностям почв в пополнении запасов элементов питания растений. В Баганском районе на значительной площади почвы нуждаются в азотных и фосфорных удобрениях, во внесении значительных доз органических удобрений.