Ізраїль до «РП5» — 8 березня 1999 року (1999 — 2002); 3-ій договір, що залучив Ізраїль до «РП6» і вступив в силу 12 травня 2004 року — 10 червня 2003 року (2002 — 2006), як з 16 грудня 2002 року. Заключний акт Договору про науково-технічне співробітництво між ЄС та Ізраїлем був підписаний і набрав чинності 16 липня 2007 та 17 грудня 2008 років відповідно.

23 грудня 2003 року була підписана і вступила в силу Угода у формі обміну між ЄС і Ізраїлю листами, що стосуються взаємних заходів з лібералізації і заміни протоколів 1 і 2 до Угоди між ЄC та Ізраїлем, що стосуються положень, що застосовуються до імпорту до Співтовариства сільськогосподарської продукції, виробленої в Ізраїлі і навпаки.

15 квітня 2008 року був підписаний і набрав чинності Протокол до Євро-середземноморського угоди на укладення Рамкової угоди між Європейським співтовариством і державою Ізраїль стосовно загальних принципів, що регулюють питання участі Ізраїлю в програмах Співтовариства.

9 грудня 2008 була підписана, а 4 листопада 2009 року набула чинності Угода між ЄС і Ізраїлем стосовно деяких аспектів повітряних послуг, мета якої  полягає в заміні окремих положень в існуючих двосторонніх угод між державами-членами ЄС та Ізраїлем і надання всім авіакомпаніям ЄС недискримінаційного доступу до маршрутів між ЄС та Ізраїлем.

11 червня 2009  була підписана і зараз розглядається Угода про процедури безпеки для обміну секретною інформацією між ЄС та Ізраїлем.

4 листопада 2009 року була підписана і 1 січня 2010 року набрала чинності Угода у формі обміну між ЄС та Ізраїлем листами, що стосуються взаємних заходів з лібералізації щодо сільськогосподарської продукції, переробленої сільськогосподарської продукції та риби і рибних продуктів, заміні протоколів 1 і 2 та їх додатків і поправок до Євро-середземноморської угоди про створення асоціації між ЄС та його державами-членами, з одного боку, і державою Ізраїль, з іншого боку.

6 травня 2010 року була підписана і 19 січня 2013 року набрав чинності Протокол до Євро-середземноморського угоди з оцінки відповідності та визнання промислових виробів (CAA). Мета цього Протоколу полягає у сприянні ліквідації