Основні фактори, що загрожують тваринам при розвитку підприємств гірничо-видобувного комплексу: руйнування місць існування, вплив інтродукованих видів, втрата, скорочення або погіршення кормової бази.
Порушення та деградація місць перебування спричиняє найбільш негативний вплив на всі групи тварин. Для тварин, що пристосувалися до певних умов протягом тисячоліть різкі їх зміни виявляються несприятливими і вони або повністю зникають, або ж стають рідкісними. Щоб зникли тварини не потрібне їх повне знищення, достатньо порушити структуру популяції. Існує норма чисельності кожного виду, нижче якої він не може існувати.
Причиною вимирання місцевих видів може бути інтродукція – переселення окремих видів у місцевість, де вони раніше не жили.
Також на тварин впливає шум гірничих підприємств і радіоактивність корисних копалин.
Господарська діяльність людини змінила гідрологічний і гідрохімічний режими водоймищ, що призводить до зниження рибопродуктивності. У водоймища потрапляють промислові стоки. Шкідливі речовини спричиняють загибель риб, кормових мікроорганізмів, втрату нерестилищ. Підігріті води, що надходять до водоймища, зумовлюють теплове забруднення, яке стимулює розвиток бактерій, що споживають кисень, збільшує вміст солей, призводить до масового розвитку водоростей і вищих рослин, підвищує чутливість водних організмів до шкідливих речовин.
Частина родовищ корисних копалин постає у вигляді розсипів, які розробляються дренажним, гідравлічним, бульдозерно-скреперним і іншими способами. При цих способах в найбільшій формі проявляється забруднення річок каламутними водами, риба зникає з них і значні площі водойм виключаються із системи нерестилищ. Загублені площі відновлюються під нерест приблизно через 10-15 років після припинення розробок, але оскільки розсипні родовища розробляються протягом 30-50 років, площі забрудненого водозбору не використовуються для відтворення рибних запасів 50-75 років.
Підсумовуючи можна сказати, що розробка родовищ корисних копалин погіршує стан рослинного і тваринного світу на великих територіях. Наслідком може стати зміна видового різноманіття, порушення харчових взаємовідносин та інше.